Protecţia Secretului de Stat reprezintă un ansamblu de măsuri organizatorico-juridice, care fac parte din sistemul naţional de protecţie a secretului de stat, privind metodele şi mijloacele utilizate de protejare a informaţiilor şi a purtătorilor materiali de informaţii atribuite la secret de stat, precum şi acţiunile întreprinse în acest domeniu, care se referă inclusiv la:
1) secretizarea şi desecretizarea informaţiilor;
2) cerinţele înaintate faţă de autorităţile publice, alte persoane juridice şi personalul acestora cu privire la protecţia secretului de stat;
3) modul de acces la secretul de stat;
4) întocmirea, evidenţa, păstrarea, procesarea, multiplicarea, utilizarea, transmiterea,distrugerea informaţiilor atribuite la secret de stat;
5) protecţia secretului de stat prin măsuri de ordin juridic şi de ordin procedural, măsuri de protecţie fizică, de protecţie a sistemelor informaţionale, de telecomunicaţii, precum şi apersonalului;
6) exercitarea controlului asupra măsurilor referitoare la protecţia secretului de stat.
Protecţia secretului de stat şi exercitarea controlului privind asigurarea păstrării şi prevenirii scurgerii informaţiilor ce constituie secret de stat şi altor informaţii importante pentru stat, prezintă una din atribuţiile de bază în activitatea Serviciului de Informaţii şi Securitate al Republicii Moldova, specificată în Legea nr. 753 din 23.12.1999, privind Serviciul de Informaţii şi Securitate al Republicii Moldova, Legea nr. 245 din 27 noiembrie 2008 cu privire la secretul de stat şi Legea59 din 29.03.2012 privind activitatea specială de investigaţii.
Evoluţia principalelor riscuri şi ameninţări privind scurgerea de informaţii protejate de stat în domeniul apărării naţionale, economiei, ştiinţei şi tehnicii, relaţiilor externe, securităţii statului,asigurării ordinii de drept şi activităţii autorităţilor publice, a căror divulgare neautorizată sau pierdere este de natură să aducă atingere intereselor şi/sau securităţii Republicii Moldova, impun amplificarea rolului Serviciului în calitatea sa de generator de securitate la organizarea sistemului naţional de protecţie a secretului de stat.
Serviciului îi revine rolul-cheie în prevenirea, minimalizarea şi anihilarea proceselor de insecuritate în domeniul protecţiei secretului de stat, prin identificarea anticipată a ameninţărilor şi a riscurilor, prin evaluarea provocărilor şi a oportunităţilor strategice, prin aplicarea unor mijloace tehnice eficiente, prin informarea autorităţilor competente în vederea adoptării deciziilor ce se impun.